Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DTX3LQ8TDB6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DTX3LQ8TDB6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DTX3LQ8TDB6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DTX3LQ8TDB6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DTX3LQ8TDB6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DTX3LQ8TDB6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DTX3LQ8TDB6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DTX3LQ8TDB6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DTX3LQ8TDB6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DTX3LQ8TDB6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DTX3LQ8TDB6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DTX3LQ8TDB6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DTX3LQ8TDB6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DTX3LQ8TDB6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DTX3LQ8TDB6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DTX3LQ8TDB6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DTX3LQ8TDB6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DTX3LQ8TDB6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DTX3LQ8TDB6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DTX3LQ8TDB6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DTX3LQ8TDB6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DTX3LQ8TDB6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DTX3LQ8TDB6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DTX3LQ8TDB6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DTX3LQ8TDB6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DTX3LQ8TDB6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DTX3LQ8TDB6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DTX3LQ8TDB6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DTX3LQ8TDB6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DTX3LQ8TDB6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DTX3LQ8TDB6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DTX3LQ8TDB6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DTX3LQ8TDB6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DTX3LQ8TDB6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DTX3LQ8TDB6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DTX3LQ8TDB6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DTX3LQ8TDB6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DTX3LQ8TDB6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DTX3LQ8TDB6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DTX3LQ8TDB6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DTX3LQ8TDB6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DTX3LQ8TDB6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DTX3LQ8TDB6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DTX3LQ8TDB6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DTX3LQ8TDB6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DTX3LQ8TDB6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms