Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MGARPQ8TDB4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MGARPQ8TDB4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MGARPQ8TDB4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MGARPQ8TDB4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MGARPQ8TDB4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MGARPQ8TDB4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MGARPQ8TDB4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MGARPQ8TDB4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MGARPQ8TDB4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MGARPQ8TDB4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MGARPQ8TDB4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MGARPQ8TDB4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MGARPQ8TDB4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MGARPQ8TDB4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MGARPQ8TDB4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MGARPQ8TDB4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MGARPQ8TDB4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MGARPQ8TDB4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MGARPQ8TDB4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MGARPQ8TDB4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MGARPQ8TDB4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MGARPQ8TDB4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MGARPQ8TDB4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MGARPQ8TDB4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MGARPQ8TDB4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MGARPQ8TDB4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MGARPQ8TDB4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MGARPQ8TDB4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
MGARPQ8TDB4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MGARPQ8TDB4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MGARPQ8TDB4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MGARPQ8TDB4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MGARPQ8TDB4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MGARPQ8TDB4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MGARPQ8TDB4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MGARPQ8TDB4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MGARPQ8TDB4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MGARPQ8TDB4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MGARPQ8TDB4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MGARPQ8TDB4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MGARPQ8TDB4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MGARPQ8TDB4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MGARPQ8TDB4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MGARPQ8TDB4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MGARPQ8TDB4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MGARPQ8TDB4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MGARPQ8TDB4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MGARPQ8TDB4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MGARPQ8TDB4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MGARPQ8TDB4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MGARPQ8TDB4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.7 ms