Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEK9Q8TD19 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEK9Q8TD19 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEK9Q8TD19 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEK9Q8TD19 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEK9Q8TD19 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NEK9Q8TD19 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEK9Q8TD19 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NEK9Q8TD19 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEK9Q8TD19 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NEK9Q8TD19 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEK9Q8TD19 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEK9Q8TD19 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEK9Q8TD19 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEK9Q8TD19 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEK9Q8TD19 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEK9Q8TD19 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEK9Q8TD19 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEK9Q8TD19 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEK9Q8TD19 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEK9Q8TD19 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEK9Q8TD19 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEK9Q8TD19 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEK9Q8TD19 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEK9Q8TD19 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NEK9Q8TD19 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEK9Q8TD19 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEK9Q8TD19 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEK9Q8TD19 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEK9Q8TD19 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEK9Q8TD19 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEK9Q8TD19 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEK9Q8TD19 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NEK9Q8TD19 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEK9Q8TD19 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEK9Q8TD19 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEK9Q8TD19 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEK9Q8TD19 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEK9Q8TD19 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEK9Q8TD19 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEK9Q8TD19 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEK9Q8TD19 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms