Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZFP28Q8NHY6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZFP28Q8NHY6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZFP28Q8NHY6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZFP28Q8NHY6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZFP28Q8NHY6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZFP28Q8NHY6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFP28Q8NHY6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFP28Q8NHY6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFP28Q8NHY6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFP28Q8NHY6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFP28Q8NHY6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZFP28Q8NHY6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFP28Q8NHY6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFP28Q8NHY6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFP28Q8NHY6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZFP28Q8NHY6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFP28Q8NHY6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFP28Q8NHY6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFP28Q8NHY6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFP28Q8NHY6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFP28Q8NHY6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFP28Q8NHY6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFP28Q8NHY6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFP28Q8NHY6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFP28Q8NHY6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFP28Q8NHY6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFP28Q8NHY6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFP28Q8NHY6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFP28Q8NHY6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZFP28Q8NHY6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZFP28Q8NHY6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFP28Q8NHY6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFP28Q8NHY6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFP28Q8NHY6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFP28Q8NHY6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFP28Q8NHY6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFP28Q8NHY6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFP28Q8NHY6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFP28Q8NHY6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFP28Q8NHY6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFP28Q8NHY6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFP28Q8NHY6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFP28Q8NHY6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms