Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYRIPQ8NFW9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYRIPQ8NFW9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYRIPQ8NFW9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MYRIPQ8NFW9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MYRIPQ8NFW9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYRIPQ8NFW9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYRIPQ8NFW9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYRIPQ8NFW9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYRIPQ8NFW9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MYRIPQ8NFW9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MYRIPQ8NFW9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MYRIPQ8NFW9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MYRIPQ8NFW9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MYRIPQ8NFW9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYRIPQ8NFW9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYRIPQ8NFW9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYRIPQ8NFW9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYRIPQ8NFW9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYRIPQ8NFW9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYRIPQ8NFW9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYRIPQ8NFW9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYRIPQ8NFW9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYRIPQ8NFW9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYRIPQ8NFW9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYRIPQ8NFW9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYRIPQ8NFW9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYRIPQ8NFW9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYRIPQ8NFW9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYRIPQ8NFW9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYRIPQ8NFW9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYRIPQ8NFW9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYRIPQ8NFW9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYRIPQ8NFW9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYRIPQ8NFW9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYRIPQ8NFW9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYRIPQ8NFW9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYRIPQ8NFW9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYRIPQ8NFW9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYRIPQ8NFW9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYRIPQ8NFW9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYRIPQ8NFW9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYRIPQ8NFW9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYRIPQ8NFW9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYRIPQ8NFW9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYRIPQ8NFW9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYRIPQ8NFW9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYRIPQ8NFW9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYRIPQ8NFW9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYRIPQ8NFW9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYRIPQ8NFW9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYRIPQ8NFW9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYRIPQ8NFW9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
MYRIPQ8NFW9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYRIPQ8NFW9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYRIPQ8NFW9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYRIPQ8NFW9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYRIPQ8NFW9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYRIPQ8NFW9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYRIPQ8NFW9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYRIPQ8NFW9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYRIPQ8NFW9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYRIPQ8NFW9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYRIPQ8NFW9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYRIPQ8NFW9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYRIPQ8NFW9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MYRIPQ8NFW9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MYRIPQ8NFW9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYRIPQ8NFW9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYRIPQ8NFW9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYRIPQ8NFW9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYRIPQ8NFW9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYRIPQ8NFW9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYRIPQ8NFW9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYRIPQ8NFW9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYRIPQ8NFW9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYRIPQ8NFW9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYRIPQ8NFW9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYRIPQ8NFW9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYRIPQ8NFW9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYRIPQ8NFW9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYRIPQ8NFW9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYRIPQ8NFW9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYRIPQ8NFW9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYRIPQ8NFW9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYRIPQ8NFW9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYRIPQ8NFW9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYRIPQ8NFW9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYRIPQ8NFW9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MYRIPQ8NFW9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYRIPQ8NFW9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYRIPQ8NFW9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYRIPQ8NFW9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYRIPQ8NFW9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYRIPQ8NFW9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYRIPQ8NFW9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYRIPQ8NFW9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYRIPQ8NFW9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYRIPQ8NFW9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYRIPQ8NFW9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms