Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF397Q8NF99 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF397Q8NF99 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF397Q8NF99 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF397Q8NF99 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF397Q8NF99 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF397Q8NF99 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF397Q8NF99 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF397Q8NF99 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF397Q8NF99 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF397Q8NF99 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF397Q8NF99 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF397Q8NF99 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF397Q8NF99 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF397Q8NF99 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF397Q8NF99 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF397Q8NF99 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF397Q8NF99 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF397Q8NF99 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF397Q8NF99 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF397Q8NF99 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF397Q8NF99 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF397Q8NF99 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF397Q8NF99 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF397Q8NF99 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF397Q8NF99 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF397Q8NF99 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF397Q8NF99 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF397Q8NF99 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF397Q8NF99 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF397Q8NF99 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF397Q8NF99 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF397Q8NF99 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF397Q8NF99 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF397Q8NF99 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF397Q8NF99 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF397Q8NF99 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF397Q8NF99 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF397Q8NF99 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF397Q8NF99 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF397Q8NF99 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF397Q8NF99 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF397Q8NF99 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF397Q8NF99 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF397Q8NF99 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF397Q8NF99 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF397Q8NF99 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF397Q8NF99 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF397Q8NF99 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF397Q8NF99 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF397Q8NF99 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF397Q8NF99 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF397Q8NF99 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF397Q8NF99 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF397Q8NF99 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF397Q8NF99 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF397Q8NF99 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF397Q8NF99 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF397Q8NF99 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF397Q8NF99 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF397Q8NF99 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF397Q8NF99 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF397Q8NF99 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF397Q8NF99 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF397Q8NF99 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF397Q8NF99 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF397Q8NF99 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF397Q8NF99 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF397Q8NF99 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms