Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIBP2Q8ND30 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIBP2Q8ND30 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIBP2Q8ND30 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIBP2Q8ND30 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIBP2Q8ND30 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIBP2Q8ND30 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIBP2Q8ND30 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIBP2Q8ND30 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIBP2Q8ND30 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIBP2Q8ND30 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIBP2Q8ND30 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIBP2Q8ND30 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIBP2Q8ND30 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIBP2Q8ND30 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIBP2Q8ND30 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIBP2Q8ND30 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIBP2Q8ND30 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIBP2Q8ND30 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIBP2Q8ND30 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIBP2Q8ND30 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIBP2Q8ND30 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIBP2Q8ND30 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIBP2Q8ND30 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIBP2Q8ND30 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIBP2Q8ND30 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIBP2Q8ND30 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIBP2Q8ND30 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIBP2Q8ND30 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIBP2Q8ND30 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIBP2Q8ND30 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIBP2Q8ND30 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIBP2Q8ND30 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIBP2Q8ND30 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIBP2Q8ND30 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIBP2Q8ND30 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIBP2Q8ND30 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIBP2Q8ND30 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIBP2Q8ND30 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIBP2Q8ND30 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIBP2Q8ND30 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIBP2Q8ND30 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIBP2Q8ND30 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIBP2Q8ND30 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIBP2Q8ND30 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIBP2Q8ND30 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIBP2Q8ND30 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIBP2Q8ND30 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPFIBP2Q8ND30 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIBP2Q8ND30 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIBP2Q8ND30 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIBP2Q8ND30 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIBP2Q8ND30 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIBP2Q8ND30 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIBP2Q8ND30 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIBP2Q8ND30 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIBP2Q8ND30 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIBP2Q8ND30 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIBP2Q8ND30 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIBP2Q8ND30 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIBP2Q8ND30 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIBP2Q8ND30 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIBP2Q8ND30 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms