Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND24

RNF214, RING finger protein 214, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF214Q8ND24 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF214Q8ND24 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF214Q8ND24 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF214Q8ND24 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF214Q8ND24 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF214Q8ND24 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF214Q8ND24 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF214Q8ND24 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF214Q8ND24 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF214Q8ND24 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF214Q8ND24 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF214Q8ND24 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF214Q8ND24 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF214Q8ND24 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF214Q8ND24 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF214Q8ND24 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF214Q8ND24 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF214Q8ND24 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF214Q8ND24 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF214Q8ND24 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF214Q8ND24 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF214Q8ND24 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
RNF214Q8ND24 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF214Q8ND24 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF214Q8ND24 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF214Q8ND24 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF214Q8ND24 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF214Q8ND24 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF214Q8ND24 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF214Q8ND24 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF214Q8ND24 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF214Q8ND24 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF214Q8ND24 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF214Q8ND24 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF214Q8ND24 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF214Q8ND24 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF214Q8ND24 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
RNF214Q8ND24 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF214Q8ND24 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RNF214Q8ND24 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RNF214Q8ND24 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RNF214Q8ND24 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF214Q8ND24 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF214Q8ND24 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF214Q8ND24 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF214Q8ND24 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF214Q8ND24 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF214Q8ND24 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF214Q8ND24 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF214Q8ND24 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF214Q8ND24 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF214Q8ND24 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF214Q8ND24 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF214Q8ND24 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RNF214Q8ND24 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RNF214Q8ND24 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF214Q8ND24 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF214Q8ND24 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF214Q8ND24 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF214Q8ND24 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF214Q8ND24 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF214Q8ND24 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF214Q8ND24 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF214Q8ND24 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF214Q8ND24 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF214Q8ND24 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF214Q8ND24 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF214Q8ND24 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF214Q8ND24 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF214Q8ND24 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF214Q8ND24 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF214Q8ND24 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF214Q8ND24 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF214Q8ND24 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF214Q8ND24 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF214Q8ND24 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF214Q8ND24 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF214Q8ND24 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF214Q8ND24 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF214Q8ND24 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF214Q8ND24 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF214Q8ND24 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF214Q8ND24 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF214Q8ND24 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF214Q8ND24 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF214Q8ND24 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF214Q8ND24 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF214Q8ND24 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF214Q8ND24 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF214Q8ND24 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF214Q8ND24 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF214Q8ND24 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RNF214Q8ND24 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF214Q8ND24 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF214Q8ND24 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF214Q8ND24 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF214Q8ND24 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF214Q8ND24 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF214Q8ND24 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF214Q8ND24 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms