Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMG8Q8ND04 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMG8Q8ND04 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMG8Q8ND04 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMG8Q8ND04 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMG8Q8ND04 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SMG8Q8ND04 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SMG8Q8ND04 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMG8Q8ND04 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMG8Q8ND04 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMG8Q8ND04 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMG8Q8ND04 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG8Q8ND04 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG8Q8ND04 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG8Q8ND04 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMG8Q8ND04 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMG8Q8ND04 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMG8Q8ND04 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMG8Q8ND04 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMG8Q8ND04 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SMG8Q8ND04 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMG8Q8ND04 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMG8Q8ND04 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMG8Q8ND04 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMG8Q8ND04 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG8Q8ND04 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG8Q8ND04 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG8Q8ND04 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG8Q8ND04 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMG8Q8ND04 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMG8Q8ND04 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMG8Q8ND04 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMG8Q8ND04 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SMG8Q8ND04 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMG8Q8ND04 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMG8Q8ND04 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SMG8Q8ND04 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMG8Q8ND04 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMG8Q8ND04 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMG8Q8ND04 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMG8Q8ND04 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMG8Q8ND04 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMG8Q8ND04 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
SMG8Q8ND04 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMG8Q8ND04 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMG8Q8ND04 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMG8Q8ND04 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMG8Q8ND04 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMG8Q8ND04 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMG8Q8ND04 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMG8Q8ND04 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMG8Q8ND04 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMG8Q8ND04 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMG8Q8ND04 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMG8Q8ND04 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMG8Q8ND04 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMG8Q8ND04 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMG8Q8ND04 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms