Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACBD4Q8NC06 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACBD4Q8NC06 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ACBD4Q8NC06 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACBD4Q8NC06 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACBD4Q8NC06 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACBD4Q8NC06 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACBD4Q8NC06 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACBD4Q8NC06 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACBD4Q8NC06 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACBD4Q8NC06 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACBD4Q8NC06 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACBD4Q8NC06 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACBD4Q8NC06 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACBD4Q8NC06 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACBD4Q8NC06 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACBD4Q8NC06 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ACBD4Q8NC06 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACBD4Q8NC06 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACBD4Q8NC06 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACBD4Q8NC06 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACBD4Q8NC06 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACBD4Q8NC06 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACBD4Q8NC06 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACBD4Q8NC06 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACBD4Q8NC06 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACBD4Q8NC06 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACBD4Q8NC06 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACBD4Q8NC06 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACBD4Q8NC06 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACBD4Q8NC06 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACBD4Q8NC06 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ACBD4Q8NC06 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACBD4Q8NC06 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACBD4Q8NC06 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACBD4Q8NC06 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ACBD4Q8NC06 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACBD4Q8NC06 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACBD4Q8NC06 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACBD4Q8NC06 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACBD4Q8NC06 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACBD4Q8NC06 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACBD4Q8NC06 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACBD4Q8NC06 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACBD4Q8NC06 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACBD4Q8NC06 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
ACBD4Q8NC06 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACBD4Q8NC06 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACBD4Q8NC06 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACBD4Q8NC06 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACBD4Q8NC06 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ACBD4Q8NC06 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACBD4Q8NC06 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACBD4Q8NC06 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACBD4Q8NC06 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACBD4Q8NC06 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACBD4Q8NC06 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACBD4Q8NC06 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACBD4Q8NC06 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACBD4Q8NC06 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACBD4Q8NC06 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACBD4Q8NC06 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACBD4Q8NC06 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACBD4Q8NC06 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACBD4Q8NC06 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACBD4Q8NC06 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACBD4Q8NC06 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACBD4Q8NC06 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACBD4Q8NC06 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACBD4Q8NC06 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACBD4Q8NC06 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACBD4Q8NC06 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACBD4Q8NC06 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms