Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RDH13Q8NBN7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RDH13Q8NBN7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RDH13Q8NBN7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RDH13Q8NBN7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RDH13Q8NBN7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RDH13Q8NBN7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RDH13Q8NBN7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RDH13Q8NBN7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RDH13Q8NBN7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RDH13Q8NBN7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RDH13Q8NBN7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RDH13Q8NBN7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RDH13Q8NBN7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RDH13Q8NBN7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RDH13Q8NBN7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RDH13Q8NBN7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RDH13Q8NBN7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RDH13Q8NBN7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RDH13Q8NBN7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RDH13Q8NBN7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RDH13Q8NBN7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RDH13Q8NBN7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RDH13Q8NBN7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RDH13Q8NBN7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RDH13Q8NBN7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RDH13Q8NBN7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RDH13Q8NBN7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RDH13Q8NBN7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RDH13Q8NBN7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RDH13Q8NBN7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RDH13Q8NBN7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RDH13Q8NBN7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RDH13Q8NBN7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RDH13Q8NBN7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RDH13Q8NBN7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RDH13Q8NBN7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RDH13Q8NBN7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RDH13Q8NBN7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RDH13Q8NBN7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RDH13Q8NBN7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RDH13Q8NBN7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RDH13Q8NBN7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RDH13Q8NBN7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RDH13Q8NBN7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
RDH13Q8NBN7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RDH13Q8NBN7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RDH13Q8NBN7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RDH13Q8NBN7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RDH13Q8NBN7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RDH13Q8NBN7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RDH13Q8NBN7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RDH13Q8NBN7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RDH13Q8NBN7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RDH13Q8NBN7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RDH13Q8NBN7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RDH13Q8NBN7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RDH13Q8NBN7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RDH13Q8NBN7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RDH13Q8NBN7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RDH13Q8NBN7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RDH13Q8NBN7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms