Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTD1Q8N815 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTD1Q8N815 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTD1Q8N815 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTD1Q8N815 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTD1Q8N815 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTD1Q8N815 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNTD1Q8N815 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTD1Q8N815 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTD1Q8N815 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTD1Q8N815 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTD1Q8N815 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTD1Q8N815 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTD1Q8N815 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTD1Q8N815 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTD1Q8N815 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTD1Q8N815 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTD1Q8N815 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTD1Q8N815 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTD1Q8N815 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTD1Q8N815 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTD1Q8N815 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTD1Q8N815 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTD1Q8N815 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTD1Q8N815 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTD1Q8N815 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTD1Q8N815 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTD1Q8N815 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTD1Q8N815 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTD1Q8N815 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTD1Q8N815 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTD1Q8N815 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTD1Q8N815 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTD1Q8N815 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTD1Q8N815 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTD1Q8N815 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTD1Q8N815 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTD1Q8N815 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTD1Q8N815 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTD1Q8N815 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTD1Q8N815 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTD1Q8N815 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTD1Q8N815 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTD1Q8N815 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTD1Q8N815 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTD1Q8N815 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTD1Q8N815 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTD1Q8N815 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTD1Q8N815 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTD1Q8N815 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTD1Q8N815 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTD1Q8N815 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTD1Q8N815 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms