Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4U5

TCP11L2, T-complex protein 11-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L2Q8N4U5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TCP11L2Q8N4U5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TCP11L2Q8N4U5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TCP11L2Q8N4U5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TCP11L2Q8N4U5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TCP11L2Q8N4U5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TCP11L2Q8N4U5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TCP11L2Q8N4U5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TCP11L2Q8N4U5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TCP11L2Q8N4U5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TCP11L2Q8N4U5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TCP11L2Q8N4U5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TCP11L2Q8N4U5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TCP11L2Q8N4U5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TCP11L2Q8N4U5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TCP11L2Q8N4U5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TCP11L2Q8N4U5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TCP11L2Q8N4U5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TCP11L2Q8N4U5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TCP11L2Q8N4U5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TCP11L2Q8N4U5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TCP11L2Q8N4U5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
TCP11L2Q8N4U5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
TCP11L2Q8N4U5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TCP11L2Q8N4U5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
TCP11L2Q8N4U5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TCP11L2Q8N4U5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TCP11L2Q8N4U5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TCP11L2Q8N4U5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
TCP11L2Q8N4U5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TCP11L2Q8N4U5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TCP11L2Q8N4U5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TCP11L2Q8N4U5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TCP11L2Q8N4U5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TCP11L2Q8N4U5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TCP11L2Q8N4U5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TCP11L2Q8N4U5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TCP11L2Q8N4U5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TCP11L2Q8N4U5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TCP11L2Q8N4U5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TCP11L2Q8N4U5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TCP11L2Q8N4U5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TCP11L2Q8N4U5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TCP11L2Q8N4U5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TCP11L2Q8N4U5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TCP11L2Q8N4U5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TCP11L2Q8N4U5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TCP11L2Q8N4U5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TCP11L2Q8N4U5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
TCP11L2Q8N4U5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TCP11L2Q8N4U5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TCP11L2Q8N4U5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TCP11L2Q8N4U5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TCP11L2Q8N4U5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
TCP11L2Q8N4U5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TCP11L2Q8N4U5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TCP11L2Q8N4U5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TCP11L2Q8N4U5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TCP11L2Q8N4U5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TCP11L2Q8N4U5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TCP11L2Q8N4U5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TCP11L2Q8N4U5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TCP11L2Q8N4U5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TCP11L2Q8N4U5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TCP11L2Q8N4U5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TCP11L2Q8N4U5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TCP11L2Q8N4U5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TCP11L2Q8N4U5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms