Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RYBPQ8N488 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RYBPQ8N488 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RYBPQ8N488 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RYBPQ8N488 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RYBPQ8N488 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RYBPQ8N488 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RYBPQ8N488 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RYBPQ8N488 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RYBPQ8N488 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RYBPQ8N488 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RYBPQ8N488 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RYBPQ8N488 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RYBPQ8N488 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RYBPQ8N488 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RYBPQ8N488 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RYBPQ8N488 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RYBPQ8N488 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RYBPQ8N488 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RYBPQ8N488 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RYBPQ8N488 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RYBPQ8N488 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RYBPQ8N488 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RYBPQ8N488 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RYBPQ8N488 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RYBPQ8N488 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RYBPQ8N488 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RYBPQ8N488 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RYBPQ8N488 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RYBPQ8N488 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RYBPQ8N488 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RYBPQ8N488 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RYBPQ8N488 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RYBPQ8N488 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RYBPQ8N488 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RYBPQ8N488 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RYBPQ8N488 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RYBPQ8N488 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RYBPQ8N488 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms