Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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