Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZM9

SLC38A6, Probable sodium-coupled neutral amino acid transporter 6, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A6Q8IZM9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A6Q8IZM9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A6Q8IZM9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A6Q8IZM9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A6Q8IZM9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A6Q8IZM9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A6Q8IZM9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A6Q8IZM9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A6Q8IZM9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A6Q8IZM9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A6Q8IZM9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A6Q8IZM9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A6Q8IZM9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms