Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYT12Q8IV01 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYT12Q8IV01 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYT12Q8IV01 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYT12Q8IV01 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYT12Q8IV01 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SYT12Q8IV01 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYT12Q8IV01 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYT12Q8IV01 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYT12Q8IV01 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYT12Q8IV01 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYT12Q8IV01 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYT12Q8IV01 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYT12Q8IV01 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYT12Q8IV01 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYT12Q8IV01 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYT12Q8IV01 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYT12Q8IV01 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYT12Q8IV01 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYT12Q8IV01 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYT12Q8IV01 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SYT12Q8IV01 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT12Q8IV01 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT12Q8IV01 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT12Q8IV01 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.2 ms