Protein–RNA interactions for Protein: Q86WR0

CCDC25, Coiled-coil domain-containing protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25Q86WR0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC25Q86WR0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC25Q86WR0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC25Q86WR0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC25Q86WR0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC25Q86WR0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC25Q86WR0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC25Q86WR0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC25Q86WR0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC25Q86WR0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC25Q86WR0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC25Q86WR0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC25Q86WR0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC25Q86WR0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC25Q86WR0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC25Q86WR0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC25Q86WR0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC25Q86WR0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC25Q86WR0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC25Q86WR0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC25Q86WR0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC25Q86WR0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC25Q86WR0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC25Q86WR0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC25Q86WR0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC25Q86WR0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC25Q86WR0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC25Q86WR0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC25Q86WR0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC25Q86WR0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC25Q86WR0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC25Q86WR0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC25Q86WR0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC25Q86WR0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC25Q86WR0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC25Q86WR0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC25Q86WR0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC25Q86WR0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC25Q86WR0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC25Q86WR0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC25Q86WR0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC25Q86WR0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC25Q86WR0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC25Q86WR0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC25Q86WR0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC25Q86WR0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC25Q86WR0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC25Q86WR0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC25Q86WR0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC25Q86WR0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC25Q86WR0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC25Q86WR0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC25Q86WR0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC25Q86WR0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC25Q86WR0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC25Q86WR0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC25Q86WR0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC25Q86WR0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC25Q86WR0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC25Q86WR0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC25Q86WR0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC25Q86WR0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms