Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZD3Q86UT5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZD3Q86UT5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZD3Q86UT5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZD3Q86UT5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZD3Q86UT5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZD3Q86UT5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZD3Q86UT5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZD3Q86UT5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZD3Q86UT5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZD3Q86UT5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZD3Q86UT5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZD3Q86UT5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZD3Q86UT5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDZD3Q86UT5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDZD3Q86UT5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZD3Q86UT5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZD3Q86UT5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDZD3Q86UT5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDZD3Q86UT5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZD3Q86UT5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZD3Q86UT5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZD3Q86UT5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDZD3Q86UT5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZD3Q86UT5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZD3Q86UT5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZD3Q86UT5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZD3Q86UT5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZD3Q86UT5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZD3Q86UT5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZD3Q86UT5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZD3Q86UT5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZD3Q86UT5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZD3Q86UT5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZD3Q86UT5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDZD3Q86UT5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZD3Q86UT5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZD3Q86UT5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms