Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX7Q7RTT5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX7Q7RTT5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX7Q7RTT5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX7Q7RTT5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX7Q7RTT5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX7Q7RTT5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX7Q7RTT5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX7Q7RTT5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX7Q7RTT5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX7Q7RTT5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX7Q7RTT5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX7Q7RTT5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX7Q7RTT5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX7Q7RTT5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX7Q7RTT5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SSX7Q7RTT5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX7Q7RTT5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms