Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDZD4Q76G19 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZD4Q76G19 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZD4Q76G19 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZD4Q76G19 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZD4Q76G19 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDZD4Q76G19 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDZD4Q76G19 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZD4Q76G19 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZD4Q76G19 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZD4Q76G19 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZD4Q76G19 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDZD4Q76G19 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDZD4Q76G19 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZD4Q76G19 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZD4Q76G19 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZD4Q76G19 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZD4Q76G19 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZD4Q76G19 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDZD4Q76G19 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZD4Q76G19 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZD4Q76G19 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZD4Q76G19 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZD4Q76G19 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDZD4Q76G19 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDZD4Q76G19 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDZD4Q76G19 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZD4Q76G19 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZD4Q76G19 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDZD4Q76G19 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDZD4Q76G19 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDZD4Q76G19 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDZD4Q76G19 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZD4Q76G19 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms