Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD7Q6ZUT3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD7Q6ZUT3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD7Q6ZUT3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMD7Q6ZUT3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMD7Q6ZUT3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRMD7Q6ZUT3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRMD7Q6ZUT3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMD7Q6ZUT3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMD7Q6ZUT3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMD7Q6ZUT3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMD7Q6ZUT3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMD7Q6ZUT3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMD7Q6ZUT3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMD7Q6ZUT3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMD7Q6ZUT3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMD7Q6ZUT3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMD7Q6ZUT3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMD7Q6ZUT3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMD7Q6ZUT3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMD7Q6ZUT3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMD7Q6ZUT3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMD7Q6ZUT3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMD7Q6ZUT3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMD7Q6ZUT3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMD7Q6ZUT3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMD7Q6ZUT3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMD7Q6ZUT3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMD7Q6ZUT3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD7Q6ZUT3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD7Q6ZUT3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD7Q6ZUT3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMD7Q6ZUT3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FRMD7Q6ZUT3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FRMD7Q6ZUT3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FRMD7Q6ZUT3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMD7Q6ZUT3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMD7Q6ZUT3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMD7Q6ZUT3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMD7Q6ZUT3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMD7Q6ZUT3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMD7Q6ZUT3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMD7Q6ZUT3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FRMD7Q6ZUT3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FRMD7Q6ZUT3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FRMD7Q6ZUT3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMD7Q6ZUT3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMD7Q6ZUT3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMD7Q6ZUT3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMD7Q6ZUT3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMD7Q6ZUT3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMD7Q6ZUT3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMD7Q6ZUT3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMD7Q6ZUT3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMD7Q6ZUT3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMD7Q6ZUT3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMD7Q6ZUT3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMD7Q6ZUT3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMD7Q6ZUT3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMD7Q6ZUT3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMD7Q6ZUT3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMD7Q6ZUT3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms