Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RBM43Q6ZSC3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RBM43Q6ZSC3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RBM43Q6ZSC3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RBM43Q6ZSC3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RBM43Q6ZSC3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RBM43Q6ZSC3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RBM43Q6ZSC3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RBM43Q6ZSC3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RBM43Q6ZSC3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RBM43Q6ZSC3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RBM43Q6ZSC3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RBM43Q6ZSC3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
RBM43Q6ZSC3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RBM43Q6ZSC3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBM43Q6ZSC3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBM43Q6ZSC3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RBM43Q6ZSC3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBM43Q6ZSC3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBM43Q6ZSC3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBM43Q6ZSC3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RBM43Q6ZSC3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RBM43Q6ZSC3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RBM43Q6ZSC3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RBM43Q6ZSC3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RBM43Q6ZSC3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RBM43Q6ZSC3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RBM43Q6ZSC3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RBM43Q6ZSC3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RBM43Q6ZSC3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RBM43Q6ZSC3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RBM43Q6ZSC3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RBM43Q6ZSC3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RBM43Q6ZSC3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RBM43Q6ZSC3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RBM43Q6ZSC3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RBM43Q6ZSC3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RBM43Q6ZSC3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBM43Q6ZSC3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RBM43Q6ZSC3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RBM43Q6ZSC3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RBM43Q6ZSC3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RBM43Q6ZSC3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RBM43Q6ZSC3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RBM43Q6ZSC3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RBM43Q6ZSC3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RBM43Q6ZSC3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RBM43Q6ZSC3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RBM43Q6ZSC3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RBM43Q6ZSC3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RBM43Q6ZSC3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM43Q6ZSC3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM43Q6ZSC3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM43Q6ZSC3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM43Q6ZSC3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM43Q6ZSC3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM43Q6ZSC3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM43Q6ZSC3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RBM43Q6ZSC3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RBM43Q6ZSC3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM43Q6ZSC3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM43Q6ZSC3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RBM43Q6ZSC3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RBM43Q6ZSC3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RBM43Q6ZSC3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RBM43Q6ZSC3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RBM43Q6ZSC3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RBM43Q6ZSC3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RBM43Q6ZSC3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RBM43Q6ZSC3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RBM43Q6ZSC3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RBM43Q6ZSC3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBM43Q6ZSC3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM43Q6ZSC3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM43Q6ZSC3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM43Q6ZSC3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM43Q6ZSC3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM43Q6ZSC3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM43Q6ZSC3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM43Q6ZSC3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RBM43Q6ZSC3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RBM43Q6ZSC3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RBM43Q6ZSC3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RBM43Q6ZSC3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM43Q6ZSC3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM43Q6ZSC3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM43Q6ZSC3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RBM43Q6ZSC3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RBM43Q6ZSC3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RBM43Q6ZSC3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RBM43Q6ZSC3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM43Q6ZSC3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM43Q6ZSC3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM43Q6ZSC3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM43Q6ZSC3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM43Q6ZSC3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM43Q6ZSC3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM43Q6ZSC3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM43Q6ZSC3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBM43Q6ZSC3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms