Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF111Q6ZNA4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF111Q6ZNA4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF111Q6ZNA4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF111Q6ZNA4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF111Q6ZNA4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF111Q6ZNA4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF111Q6ZNA4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF111Q6ZNA4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF111Q6ZNA4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF111Q6ZNA4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF111Q6ZNA4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF111Q6ZNA4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF111Q6ZNA4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF111Q6ZNA4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF111Q6ZNA4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF111Q6ZNA4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF111Q6ZNA4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF111Q6ZNA4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF111Q6ZNA4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF111Q6ZNA4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF111Q6ZNA4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF111Q6ZNA4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF111Q6ZNA4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF111Q6ZNA4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF111Q6ZNA4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF111Q6ZNA4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF111Q6ZNA4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF111Q6ZNA4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF111Q6ZNA4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF111Q6ZNA4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF111Q6ZNA4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RNF111Q6ZNA4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF111Q6ZNA4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms