Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms