Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF05

TTC23L, Tetratricopeptide repeat protein 23-like, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23LQ6PF05 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC23LQ6PF05 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC23LQ6PF05 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC23LQ6PF05 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC23LQ6PF05 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC23LQ6PF05 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC23LQ6PF05 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC23LQ6PF05 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC23LQ6PF05 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC23LQ6PF05 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC23LQ6PF05 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC23LQ6PF05 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC23LQ6PF05 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms