Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUJ2

C11orf87, Uncharacterized protein C11orf87, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf87Q6NUJ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf87Q6NUJ2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf87Q6NUJ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf87Q6NUJ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C11orf87Q6NUJ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf87Q6NUJ2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms