Protein–RNA interactions for Protein: Q6IN84

MRM1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRM1Q6IN84 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRM1Q6IN84 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRM1Q6IN84 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRM1Q6IN84 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRM1Q6IN84 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRM1Q6IN84 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRM1Q6IN84 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MRM1Q6IN84 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRM1Q6IN84 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRM1Q6IN84 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRM1Q6IN84 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRM1Q6IN84 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRM1Q6IN84 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRM1Q6IN84 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRM1Q6IN84 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRM1Q6IN84 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRM1Q6IN84 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRM1Q6IN84 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRM1Q6IN84 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRM1Q6IN84 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRM1Q6IN84 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRM1Q6IN84 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRM1Q6IN84 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRM1Q6IN84 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRM1Q6IN84 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRM1Q6IN84 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRM1Q6IN84 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRM1Q6IN84 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRM1Q6IN84 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MRM1Q6IN84 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRM1Q6IN84 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRM1Q6IN84 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRM1Q6IN84 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRM1Q6IN84 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRM1Q6IN84 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRM1Q6IN84 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRM1Q6IN84 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRM1Q6IN84 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MRM1Q6IN84 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRM1Q6IN84 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRM1Q6IN84 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRM1Q6IN84 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRM1Q6IN84 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRM1Q6IN84 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRM1Q6IN84 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRM1Q6IN84 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRM1Q6IN84 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRM1Q6IN84 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRM1Q6IN84 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRM1Q6IN84 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRM1Q6IN84 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRM1Q6IN84 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRM1Q6IN84 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MRM1Q6IN84 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRM1Q6IN84 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRM1Q6IN84 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRM1Q6IN84 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRM1Q6IN84 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms