Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms