Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
MCTP1Q6DN14 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MCTP1Q6DN14 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
MCTP1Q6DN14 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
MCTP1Q6DN14 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MCTP1Q6DN14 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MCTP1Q6DN14 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MCTP1Q6DN14 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MCTP1Q6DN14 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MCTP1Q6DN14 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MCTP1Q6DN14 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MCTP1Q6DN14 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
MCTP1Q6DN14 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MCTP1Q6DN14 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MCTP1Q6DN14 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MCTP1Q6DN14 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MCTP1Q6DN14 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MCTP1Q6DN14 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MCTP1Q6DN14 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MCTP1Q6DN14 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MCTP1Q6DN14 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MCTP1Q6DN14 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
MCTP1Q6DN14 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
MCTP1Q6DN14 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
MCTP1Q6DN14 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MCTP1Q6DN14 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MCTP1Q6DN14 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MCTP1Q6DN14 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MCTP1Q6DN14 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MCTP1Q6DN14 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MCTP1Q6DN14 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MCTP1Q6DN14 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
MCTP1Q6DN14 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
MCTP1Q6DN14 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MCTP1Q6DN14 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MCTP1Q6DN14 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MCTP1Q6DN14 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MCTP1Q6DN14 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MCTP1Q6DN14 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MCTP1Q6DN14 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MCTP1Q6DN14 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MCTP1Q6DN14 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MCTP1Q6DN14 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MCTP1Q6DN14 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MCTP1Q6DN14 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MCTP1Q6DN14 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MCTP1Q6DN14 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MCTP1Q6DN14 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MCTP1Q6DN14 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MCTP1Q6DN14 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MCTP1Q6DN14 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MCTP1Q6DN14 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MCTP1Q6DN14 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
MCTP1Q6DN14 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
MCTP1Q6DN14 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
MCTP1Q6DN14 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
MCTP1Q6DN14 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MCTP1Q6DN14 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MCTP1Q6DN14 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MCTP1Q6DN14 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
MCTP1Q6DN14 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
MCTP1Q6DN14 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MCTP1Q6DN14 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
MCTP1Q6DN14 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
MCTP1Q6DN14 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MCTP1Q6DN14 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MCTP1Q6DN14 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
MCTP1Q6DN14 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
MCTP1Q6DN14 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MCTP1Q6DN14 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
MCTP1Q6DN14 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MCTP1Q6DN14 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MCTP1Q6DN14 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MCTP1Q6DN14 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MCTP1Q6DN14 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
MCTP1Q6DN14 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MCTP1Q6DN14 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MCTP1Q6DN14 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MCTP1Q6DN14 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MCTP1Q6DN14 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MCTP1Q6DN14 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MCTP1Q6DN14 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms