Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF43Q68DV7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF43Q68DV7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF43Q68DV7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF43Q68DV7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF43Q68DV7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF43Q68DV7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF43Q68DV7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF43Q68DV7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF43Q68DV7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF43Q68DV7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF43Q68DV7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF43Q68DV7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF43Q68DV7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF43Q68DV7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF43Q68DV7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF43Q68DV7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF43Q68DV7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF43Q68DV7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF43Q68DV7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF43Q68DV7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF43Q68DV7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF43Q68DV7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF43Q68DV7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF43Q68DV7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF43Q68DV7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF43Q68DV7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RNF43Q68DV7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF43Q68DV7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF43Q68DV7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF43Q68DV7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF43Q68DV7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF43Q68DV7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF43Q68DV7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF43Q68DV7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF43Q68DV7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF43Q68DV7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF43Q68DV7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF43Q68DV7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF43Q68DV7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF43Q68DV7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF43Q68DV7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF43Q68DV7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF43Q68DV7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF43Q68DV7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF43Q68DV7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF43Q68DV7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF43Q68DV7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF43Q68DV7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF43Q68DV7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF43Q68DV7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF43Q68DV7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF43Q68DV7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF43Q68DV7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF43Q68DV7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF43Q68DV7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF43Q68DV7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF43Q68DV7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF43Q68DV7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF43Q68DV7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF43Q68DV7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF43Q68DV7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF43Q68DV7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF43Q68DV7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RNF43Q68DV7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF43Q68DV7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF43Q68DV7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF43Q68DV7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF43Q68DV7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RNF43Q68DV7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF43Q68DV7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF43Q68DV7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms