Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
E4F1Q66K89 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
E4F1Q66K89 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
E4F1Q66K89 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
E4F1Q66K89 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
E4F1Q66K89 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
E4F1Q66K89 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
E4F1Q66K89 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
E4F1Q66K89 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
E4F1Q66K89 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
E4F1Q66K89 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
E4F1Q66K89 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
E4F1Q66K89 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
E4F1Q66K89 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
E4F1Q66K89 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
E4F1Q66K89 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
E4F1Q66K89 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
E4F1Q66K89 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
E4F1Q66K89 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
E4F1Q66K89 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
E4F1Q66K89 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
E4F1Q66K89 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
E4F1Q66K89 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
E4F1Q66K89 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
E4F1Q66K89 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
E4F1Q66K89 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
E4F1Q66K89 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
E4F1Q66K89 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
E4F1Q66K89 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
E4F1Q66K89 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
E4F1Q66K89 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
E4F1Q66K89 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
E4F1Q66K89 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
E4F1Q66K89 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
E4F1Q66K89 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
E4F1Q66K89 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
E4F1Q66K89 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
E4F1Q66K89 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
E4F1Q66K89 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
E4F1Q66K89 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
E4F1Q66K89 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
E4F1Q66K89 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
E4F1Q66K89 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
E4F1Q66K89 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
E4F1Q66K89 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
E4F1Q66K89 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
E4F1Q66K89 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
E4F1Q66K89 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
E4F1Q66K89 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
E4F1Q66K89 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
E4F1Q66K89 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
E4F1Q66K89 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
E4F1Q66K89 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
E4F1Q66K89 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
E4F1Q66K89 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
E4F1Q66K89 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
E4F1Q66K89 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
E4F1Q66K89 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
E4F1Q66K89 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
E4F1Q66K89 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
E4F1Q66K89 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
E4F1Q66K89 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
E4F1Q66K89 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
E4F1Q66K89 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
E4F1Q66K89 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
E4F1Q66K89 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
E4F1Q66K89 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
E4F1Q66K89 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
E4F1Q66K89 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
E4F1Q66K89 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
E4F1Q66K89 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
E4F1Q66K89 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
E4F1Q66K89 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
E4F1Q66K89 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
E4F1Q66K89 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
E4F1Q66K89 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
E4F1Q66K89 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
E4F1Q66K89 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
E4F1Q66K89 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
E4F1Q66K89 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
E4F1Q66K89 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
E4F1Q66K89 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
E4F1Q66K89 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
E4F1Q66K89 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms