Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG85

Putative UPF0633 protein LOC554249, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XG85 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5XG85 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5XG85 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5XG85 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q5XG85 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q5XG85 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q5XG85 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q5XG85 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q5XG85 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q5XG85 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q5XG85 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q5XG85 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q5XG85 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q5XG85 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q5XG85 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q5XG85 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q5XG85 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q5XG85 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q5XG85 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q5XG85 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q5XG85 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q5XG85 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q5XG85 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q5XG85 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q5XG85 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q5XG85 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q5XG85 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q5XG85 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q5XG85 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q5XG85 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q5XG85 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q5XG85 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q5XG85 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q5XG85 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q5XG85 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q5XG85 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q5XG85 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q5XG85 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q5XG85 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q5XG85 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q5XG85 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q5XG85 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q5XG85 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q5XG85 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q5XG85 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q5XG85 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q5XG85 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q5XG85 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q5XG85 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q5XG85 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q5XG85 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q5XG85 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q5XG85 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q5XG85 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q5XG85 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q5XG85 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q5XG85 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q5XG85 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q5XG85 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Q5XG85 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q5XG85 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5XG85 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5XG85 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5XG85 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5XG85 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5XG85 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5XG85 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5XG85 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5XG85 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5XG85 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5XG85 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5XG85 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5XG85 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5XG85 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5XG85 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5XG85 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5XG85 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5XG85 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5XG85 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5XG85 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5XG85 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5XG85 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5XG85 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q5XG85 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q5XG85 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q5XG85 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q5XG85 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q5XG85 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q5XG85 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q5XG85 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q5XG85 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q5XG85 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q5XG85 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q5XG85 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q5XG85 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q5XG85 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q5XG85 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q5XG85 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q5XG85 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q5XG85 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms