Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GARNL3Q5VVW2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GARNL3Q5VVW2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GARNL3Q5VVW2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GARNL3Q5VVW2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GARNL3Q5VVW2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GARNL3Q5VVW2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GARNL3Q5VVW2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GARNL3Q5VVW2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GARNL3Q5VVW2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GARNL3Q5VVW2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GARNL3Q5VVW2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GARNL3Q5VVW2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GARNL3Q5VVW2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GARNL3Q5VVW2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GARNL3Q5VVW2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GARNL3Q5VVW2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GARNL3Q5VVW2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GARNL3Q5VVW2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GARNL3Q5VVW2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GARNL3Q5VVW2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GARNL3Q5VVW2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GARNL3Q5VVW2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GARNL3Q5VVW2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GARNL3Q5VVW2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GARNL3Q5VVW2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GARNL3Q5VVW2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GARNL3Q5VVW2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GARNL3Q5VVW2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GARNL3Q5VVW2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GARNL3Q5VVW2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GARNL3Q5VVW2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GARNL3Q5VVW2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GARNL3Q5VVW2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GARNL3Q5VVW2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GARNL3Q5VVW2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GARNL3Q5VVW2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GARNL3Q5VVW2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GARNL3Q5VVW2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms