Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
RNF20Q5VTR2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RNF20Q5VTR2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RNF20Q5VTR2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
RNF20Q5VTR2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
RNF20Q5VTR2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RNF20Q5VTR2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RNF20Q5VTR2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RNF20Q5VTR2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RNF20Q5VTR2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RNF20Q5VTR2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RNF20Q5VTR2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RNF20Q5VTR2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RNF20Q5VTR2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RNF20Q5VTR2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RNF20Q5VTR2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RNF20Q5VTR2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RNF20Q5VTR2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RNF20Q5VTR2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
RNF20Q5VTR2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF20Q5VTR2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF20Q5VTR2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF20Q5VTR2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF20Q5VTR2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF20Q5VTR2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RNF20Q5VTR2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RNF20Q5VTR2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RNF20Q5VTR2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RNF20Q5VTR2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RNF20Q5VTR2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RNF20Q5VTR2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RNF20Q5VTR2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RNF20Q5VTR2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RNF20Q5VTR2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RNF20Q5VTR2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
RNF20Q5VTR2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RNF20Q5VTR2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RNF20Q5VTR2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RNF20Q5VTR2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RNF20Q5VTR2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RNF20Q5VTR2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RNF20Q5VTR2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RNF20Q5VTR2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RNF20Q5VTR2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RNF20Q5VTR2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RNF20Q5VTR2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RNF20Q5VTR2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RNF20Q5VTR2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
RNF20Q5VTR2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RNF20Q5VTR2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
RNF20Q5VTR2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RNF20Q5VTR2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RNF20Q5VTR2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
RNF20Q5VTR2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RNF20Q5VTR2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RNF20Q5VTR2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RNF20Q5VTR2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RNF20Q5VTR2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms