Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCN1P1Q5VSP4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCN1P1Q5VSP4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCN1P1Q5VSP4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCN1P1Q5VSP4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCN1P1Q5VSP4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCN1P1Q5VSP4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCN1P1Q5VSP4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCN1P1Q5VSP4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCN1P1Q5VSP4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCN1P1Q5VSP4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCN1P1Q5VSP4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCN1P1Q5VSP4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCN1P1Q5VSP4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LCN1P1Q5VSP4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCN1P1Q5VSP4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN1P1Q5VSP4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN1P1Q5VSP4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN1P1Q5VSP4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN1P1Q5VSP4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN1P1Q5VSP4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN1P1Q5VSP4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN1P1Q5VSP4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCN1P1Q5VSP4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCN1P1Q5VSP4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCN1P1Q5VSP4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LCN1P1Q5VSP4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCN1P1Q5VSP4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCN1P1Q5VSP4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCN1P1Q5VSP4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCN1P1Q5VSP4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LCN1P1Q5VSP4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCN1P1Q5VSP4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCN1P1Q5VSP4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms