Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PITRM1Q5JRX3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PITRM1Q5JRX3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PITRM1Q5JRX3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PITRM1Q5JRX3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PITRM1Q5JRX3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PITRM1Q5JRX3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PITRM1Q5JRX3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PITRM1Q5JRX3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PITRM1Q5JRX3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PITRM1Q5JRX3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PITRM1Q5JRX3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PITRM1Q5JRX3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PITRM1Q5JRX3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PITRM1Q5JRX3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PITRM1Q5JRX3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PITRM1Q5JRX3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PITRM1Q5JRX3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PITRM1Q5JRX3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PITRM1Q5JRX3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PITRM1Q5JRX3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PITRM1Q5JRX3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PITRM1Q5JRX3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PITRM1Q5JRX3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PITRM1Q5JRX3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PITRM1Q5JRX3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PITRM1Q5JRX3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PITRM1Q5JRX3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PITRM1Q5JRX3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PITRM1Q5JRX3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PITRM1Q5JRX3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PITRM1Q5JRX3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PITRM1Q5JRX3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PITRM1Q5JRX3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PITRM1Q5JRX3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PITRM1Q5JRX3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PITRM1Q5JRX3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PITRM1Q5JRX3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PITRM1Q5JRX3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PITRM1Q5JRX3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PITRM1Q5JRX3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PITRM1Q5JRX3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PITRM1Q5JRX3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PITRM1Q5JRX3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PITRM1Q5JRX3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PITRM1Q5JRX3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PITRM1Q5JRX3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PITRM1Q5JRX3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms