Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SFT2D3Q587I9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFT2D3Q587I9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFT2D3Q587I9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFT2D3Q587I9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFT2D3Q587I9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SFT2D3Q587I9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SFT2D3Q587I9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFT2D3Q587I9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFT2D3Q587I9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFT2D3Q587I9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFT2D3Q587I9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFT2D3Q587I9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFT2D3Q587I9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFT2D3Q587I9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFT2D3Q587I9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFT2D3Q587I9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFT2D3Q587I9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFT2D3Q587I9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFT2D3Q587I9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFT2D3Q587I9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFT2D3Q587I9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFT2D3Q587I9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SFT2D3Q587I9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFT2D3Q587I9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFT2D3Q587I9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFT2D3Q587I9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFT2D3Q587I9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFT2D3Q587I9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SFT2D3Q587I9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SFT2D3Q587I9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFT2D3Q587I9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFT2D3Q587I9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFT2D3Q587I9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFT2D3Q587I9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFT2D3Q587I9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFT2D3Q587I9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFT2D3Q587I9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFT2D3Q587I9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFT2D3Q587I9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFT2D3Q587I9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFT2D3Q587I9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFT2D3Q587I9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFT2D3Q587I9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFT2D3Q587I9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SFT2D3Q587I9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFT2D3Q587I9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFT2D3Q587I9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SFT2D3Q587I9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFT2D3Q587I9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFT2D3Q587I9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFT2D3Q587I9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFT2D3Q587I9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFT2D3Q587I9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFT2D3Q587I9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFT2D3Q587I9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFT2D3Q587I9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFT2D3Q587I9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms