Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMM50Q3ZCQ8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMM50Q3ZCQ8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMM50Q3ZCQ8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMM50Q3ZCQ8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMM50Q3ZCQ8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMM50Q3ZCQ8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMM50Q3ZCQ8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMM50Q3ZCQ8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMM50Q3ZCQ8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMM50Q3ZCQ8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMM50Q3ZCQ8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMM50Q3ZCQ8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIMM50Q3ZCQ8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIMM50Q3ZCQ8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMM50Q3ZCQ8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMM50Q3ZCQ8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMM50Q3ZCQ8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMM50Q3ZCQ8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMM50Q3ZCQ8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMM50Q3ZCQ8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMM50Q3ZCQ8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMM50Q3ZCQ8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMM50Q3ZCQ8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMM50Q3ZCQ8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMM50Q3ZCQ8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMM50Q3ZCQ8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIMM50Q3ZCQ8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIMM50Q3ZCQ8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIMM50Q3ZCQ8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TIMM50Q3ZCQ8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TIMM50Q3ZCQ8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TIMM50Q3ZCQ8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TIMM50Q3ZCQ8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIMM50Q3ZCQ8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMM50Q3ZCQ8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMM50Q3ZCQ8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMM50Q3ZCQ8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMM50Q3ZCQ8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMM50Q3ZCQ8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMM50Q3ZCQ8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMM50Q3ZCQ8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMM50Q3ZCQ8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM50Q3ZCQ8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM50Q3ZCQ8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM50Q3ZCQ8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM50Q3ZCQ8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM50Q3ZCQ8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMM50Q3ZCQ8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMM50Q3ZCQ8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMM50Q3ZCQ8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMM50Q3ZCQ8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMM50Q3ZCQ8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMM50Q3ZCQ8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms