Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRAMD1BQ3KR37 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRAMD1BQ3KR37 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRAMD1BQ3KR37 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRAMD1BQ3KR37 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRAMD1BQ3KR37 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRAMD1BQ3KR37 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRAMD1BQ3KR37 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRAMD1BQ3KR37 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRAMD1BQ3KR37 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRAMD1BQ3KR37 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRAMD1BQ3KR37 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRAMD1BQ3KR37 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRAMD1BQ3KR37 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRAMD1BQ3KR37 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD1BQ3KR37 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD1BQ3KR37 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD1BQ3KR37 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRAMD1BQ3KR37 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRAMD1BQ3KR37 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRAMD1BQ3KR37 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRAMD1BQ3KR37 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRAMD1BQ3KR37 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRAMD1BQ3KR37 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRAMD1BQ3KR37 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRAMD1BQ3KR37 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRAMD1BQ3KR37 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRAMD1BQ3KR37 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRAMD1BQ3KR37 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRAMD1BQ3KR37 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRAMD1BQ3KR37 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRAMD1BQ3KR37 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRAMD1BQ3KR37 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRAMD1BQ3KR37 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRAMD1BQ3KR37 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1BQ3KR37 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1BQ3KR37 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1BQ3KR37 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1BQ3KR37 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms