Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HFEQ30201 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HFEQ30201 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HFEQ30201 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HFEQ30201 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HFEQ30201 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HFEQ30201 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HFEQ30201 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HFEQ30201 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HFEQ30201 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HFEQ30201 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HFEQ30201 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HFEQ30201 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HFEQ30201 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HFEQ30201 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HFEQ30201 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HFEQ30201 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HFEQ30201 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HFEQ30201 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HFEQ30201 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HFEQ30201 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HFEQ30201 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HFEQ30201 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HFEQ30201 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HFEQ30201 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HFEQ30201 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HFEQ30201 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HFEQ30201 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HFEQ30201 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HFEQ30201 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HFEQ30201 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HFEQ30201 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HFEQ30201 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HFEQ30201 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HFEQ30201 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HFEQ30201 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HFEQ30201 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HFEQ30201 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HFEQ30201 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HFEQ30201 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HFEQ30201 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HFEQ30201 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HFEQ30201 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HFEQ30201 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HFEQ30201 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HFEQ30201 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HFEQ30201 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HFEQ30201 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HFEQ30201 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HFEQ30201 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HFEQ30201 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HFEQ30201 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HFEQ30201 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HFEQ30201 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HFEQ30201 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HFEQ30201 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HFEQ30201 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HFEQ30201 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HFEQ30201 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HFEQ30201 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HFEQ30201 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HFEQ30201 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HFEQ30201 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HFEQ30201 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HFEQ30201 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HFEQ30201 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HFEQ30201 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HFEQ30201 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HFEQ30201 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HFEQ30201 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HFEQ30201 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HFEQ30201 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HFEQ30201 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HFEQ30201 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HFEQ30201 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HFEQ30201 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HFEQ30201 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HFEQ30201 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HFEQ30201 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HFEQ30201 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HFEQ30201 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HFEQ30201 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HFEQ30201 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HFEQ30201 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HFEQ30201 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HFEQ30201 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HFEQ30201 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HFEQ30201 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HFEQ30201 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HFEQ30201 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HFEQ30201 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HFEQ30201 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HFEQ30201 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HFEQ30201 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HFEQ30201 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HFEQ30201 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HFEQ30201 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HFEQ30201 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HFEQ30201 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HFEQ30201 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms