Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMN1Q16637 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMN1Q16637 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMN1Q16637 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMN1Q16637 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMN1Q16637 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMN1Q16637 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMN1Q16637 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMN1Q16637 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMN1Q16637 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMN1Q16637 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMN1Q16637 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMN1Q16637 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMN1Q16637 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMN1Q16637 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMN1Q16637 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMN1Q16637 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMN1Q16637 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMN1Q16637 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMN1Q16637 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMN1Q16637 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMN1Q16637 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMN1Q16637 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMN1Q16637 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMN1Q16637 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMN1Q16637 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMN1Q16637 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMN1Q16637 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMN1Q16637 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMN1Q16637 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMN1Q16637 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMN1Q16637 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMN1Q16637 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMN1Q16637 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMN1Q16637 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMN1Q16637 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMN1Q16637 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMN1Q16637 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMN1Q16637 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMN1Q16637 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMN1Q16637 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMN1Q16637 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMN1Q16637 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMN1Q16637 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMN1Q16637 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMN1Q16637 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMN1Q16637 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMN1Q16637 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMN1Q16637 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMN1Q16637 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMN1Q16637 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMN1Q16637 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMN1Q16637 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMN1Q16637 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMN1Q16637 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMN1Q16637 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMN1Q16637 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMN1Q16637 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMN1Q16637 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMN1Q16637 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
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