Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.59■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
NCOA1Q15788 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NCOA1Q15788 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
NCOA1Q15788 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
NCOA1Q15788 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NCOA1Q15788 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NCOA1Q15788 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NCOA1Q15788 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
NCOA1Q15788 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NCOA1Q15788 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NCOA1Q15788 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
NCOA1Q15788 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.36■■■■■ 4.05
NCOA1Q15788 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
NCOA1Q15788 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NCOA1Q15788 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NCOA1Q15788 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NCOA1Q15788 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NCOA1Q15788 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.3■■■■■ 4.04
NCOA1Q15788 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
NCOA1Q15788 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
NCOA1Q15788 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
NCOA1Q15788 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
NCOA1Q15788 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NCOA1Q15788 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
NCOA1Q15788 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.14■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NCOA1Q15788 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NCOA1Q15788 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NCOA1Q15788 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
NCOA1Q15788 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
NCOA1Q15788 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
NCOA1Q15788 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
NCOA1Q15788 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
NCOA1Q15788 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
NCOA1Q15788 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.03■■■■■ 4
NCOA1Q15788 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
NCOA1Q15788 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.02■■■■■ 4
NCOA1Q15788 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NCOA1Q15788 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.97■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
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