Protein–RNA interactions for Protein: Q15782

CHI3L2, Chitinase-3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L2Q15782 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CHI3L2Q15782 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHI3L2Q15782 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHI3L2Q15782 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHI3L2Q15782 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHI3L2Q15782 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHI3L2Q15782 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHI3L2Q15782 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHI3L2Q15782 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CHI3L2Q15782 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHI3L2Q15782 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHI3L2Q15782 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHI3L2Q15782 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHI3L2Q15782 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHI3L2Q15782 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHI3L2Q15782 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHI3L2Q15782 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHI3L2Q15782 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHI3L2Q15782 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHI3L2Q15782 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHI3L2Q15782 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHI3L2Q15782 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHI3L2Q15782 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHI3L2Q15782 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHI3L2Q15782 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHI3L2Q15782 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHI3L2Q15782 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHI3L2Q15782 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHI3L2Q15782 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHI3L2Q15782 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHI3L2Q15782 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHI3L2Q15782 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHI3L2Q15782 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHI3L2Q15782 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHI3L2Q15782 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHI3L2Q15782 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHI3L2Q15782 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHI3L2Q15782 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHI3L2Q15782 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHI3L2Q15782 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHI3L2Q15782 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHI3L2Q15782 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHI3L2Q15782 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHI3L2Q15782 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHI3L2Q15782 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHI3L2Q15782 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHI3L2Q15782 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms