Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PTPRKQ15262 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PTPRKQ15262 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
PTPRKQ15262 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
PTPRKQ15262 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
PTPRKQ15262 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.77■■■■■ 4.12
PTPRKQ15262 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
PTPRKQ15262 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PTPRKQ15262 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PTPRKQ15262 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
PTPRKQ15262 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PTPRKQ15262 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PTPRKQ15262 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PTPRKQ15262 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
PTPRKQ15262 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
PTPRKQ15262 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
PTPRKQ15262 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PTPRKQ15262 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PTPRKQ15262 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PTPRKQ15262 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PTPRKQ15262 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PTPRKQ15262 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PTPRKQ15262 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
PTPRKQ15262 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PTPRKQ15262 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
PTPRKQ15262 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
PTPRKQ15262 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PTPRKQ15262 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
PTPRKQ15262 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
PTPRKQ15262 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
PTPRKQ15262 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
PTPRKQ15262 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PTPRKQ15262 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PTPRKQ15262 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
PTPRKQ15262 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
PTPRKQ15262 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
PTPRKQ15262 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
PTPRKQ15262 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
PTPRKQ15262 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
PTPRKQ15262 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PTPRKQ15262 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PTPRKQ15262 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
PTPRKQ15262 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
PTPRKQ15262 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PTPRKQ15262 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PTPRKQ15262 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PTPRKQ15262 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
PTPRKQ15262 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
PTPRKQ15262 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
PTPRKQ15262 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PTPRKQ15262 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
PTPRKQ15262 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
PTPRKQ15262 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
PTPRKQ15262 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
PTPRKQ15262 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PTPRKQ15262 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PTPRKQ15262 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PTPRKQ15262 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
PTPRKQ15262 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
PTPRKQ15262 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
PTPRKQ15262 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PTPRKQ15262 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PTPRKQ15262 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PTPRKQ15262 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PTPRKQ15262 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
PTPRKQ15262 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PTPRKQ15262 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PTPRKQ15262 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
PTPRKQ15262 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
PTPRKQ15262 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
PTPRKQ15262 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PTPRKQ15262 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PTPRKQ15262 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
PTPRKQ15262 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PTPRKQ15262 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PTPRKQ15262 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
PTPRKQ15262 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
PTPRKQ15262 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
PTPRKQ15262 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
PTPRKQ15262 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
PTPRKQ15262 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PTPRKQ15262 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PTPRKQ15262 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PTPRKQ15262 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
PTPRKQ15262 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PTPRKQ15262 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.27■■■■■ 4.04
PTPRKQ15262 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PTPRKQ15262 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
PTPRKQ15262 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PTPRKQ15262 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PTPRKQ15262 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PTPRKQ15262 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
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