Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SQLEQ14534 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SQLEQ14534 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SQLEQ14534 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SQLEQ14534 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SQLEQ14534 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SQLEQ14534 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SQLEQ14534 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SQLEQ14534 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SQLEQ14534 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SQLEQ14534 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SQLEQ14534 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SQLEQ14534 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SQLEQ14534 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SQLEQ14534 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SQLEQ14534 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SQLEQ14534 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SQLEQ14534 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SQLEQ14534 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SQLEQ14534 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SQLEQ14534 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SQLEQ14534 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SQLEQ14534 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SQLEQ14534 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SQLEQ14534 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SQLEQ14534 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SQLEQ14534 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SQLEQ14534 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SQLEQ14534 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SQLEQ14534 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SQLEQ14534 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SQLEQ14534 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SQLEQ14534 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SQLEQ14534 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SQLEQ14534 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SQLEQ14534 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SQLEQ14534 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SQLEQ14534 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SQLEQ14534 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SQLEQ14534 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SQLEQ14534 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SQLEQ14534 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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