Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM25Q14258 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM25Q14258 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM25Q14258 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM25Q14258 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM25Q14258 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM25Q14258 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM25Q14258 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM25Q14258 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM25Q14258 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM25Q14258 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM25Q14258 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM25Q14258 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM25Q14258 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM25Q14258 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM25Q14258 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM25Q14258 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM25Q14258 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM25Q14258 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM25Q14258 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM25Q14258 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM25Q14258 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM25Q14258 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM25Q14258 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM25Q14258 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM25Q14258 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM25Q14258 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM25Q14258 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM25Q14258 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM25Q14258 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM25Q14258 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM25Q14258 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM25Q14258 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM25Q14258 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM25Q14258 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM25Q14258 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM25Q14258 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM25Q14258 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM25Q14258 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM25Q14258 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM25Q14258 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM25Q14258 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM25Q14258 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM25Q14258 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM25Q14258 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM25Q14258 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM25Q14258 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM25Q14258 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM25Q14258 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM25Q14258 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM25Q14258 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM25Q14258 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM25Q14258 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM25Q14258 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM25Q14258 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM25Q14258 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM25Q14258 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM25Q14258 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM25Q14258 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM25Q14258 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM25Q14258 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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