Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIRBPQ14011 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIRBPQ14011 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIRBPQ14011 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIRBPQ14011 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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