Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC2Q13868 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC2Q13868 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC2Q13868 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC2Q13868 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC2Q13868 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC2Q13868 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC2Q13868 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC2Q13868 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC2Q13868 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC2Q13868 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC2Q13868 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC2Q13868 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC2Q13868 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC2Q13868 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC2Q13868 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC2Q13868 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC2Q13868 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC2Q13868 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC2Q13868 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC2Q13868 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC2Q13868 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC2Q13868 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC2Q13868 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC2Q13868 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC2Q13868 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC2Q13868 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC2Q13868 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC2Q13868 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC2Q13868 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC2Q13868 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC2Q13868 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC2Q13868 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC2Q13868 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC2Q13868 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC2Q13868 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC2Q13868 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC2Q13868 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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