Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNTA1Q13424 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNTA1Q13424 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SNTA1Q13424 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNTA1Q13424 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNTA1Q13424 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNTA1Q13424 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNTA1Q13424 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNTA1Q13424 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNTA1Q13424 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNTA1Q13424 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNTA1Q13424 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNTA1Q13424 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNTA1Q13424 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNTA1Q13424 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNTA1Q13424 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNTA1Q13424 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SNTA1Q13424 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNTA1Q13424 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms